病毒性腸炎一般不需病原治療，可自愈。腸毒素性細菌性腸炎一般也不應用抗菌藥。侵襲性細菌性腸炎，最好根據細菌藥物敏感試驗結果選用抗菌藥。患細菌性痢疾時，因痢疾桿菌對常用抗菌藥廣泛耐藥，一般可選用復方磺胺甲基異唑(復方新諾明)、吡哌酸、慶大霉素、丁胺卡那霉素等。空腸彎曲菌腸炎可用紅霉素、慶大霉素、氯霉素等治療。耶爾森氏小腸結腸炎桿菌腸炎一般應用慶大霉素、卡那霉素、復方磺胺甲基異唑、四環素、氯霉素等。沙門氏菌腸炎輕型病人可不用抗菌藥，重型病人可用氯霉素或復方磺胺甲基異唑。侵襲性大腸桿菌性腸炎用新霉素、粘菌素和慶大霉素等治療，可獲良好效果。阿米巴痢疾、雅爾氏鞭毛蟲和滴蟲引起的腸炎，可用甲硝噠唑(滅滴靈)治療。血吸蟲病可用吡喹酮治療。白色念珠菌腸炎以制霉菌素口服，療效較好。伴有全身性真菌感染者，則需應用二性霉素b治療。
常用方法
補充液體及糾正電解質和酸中毒
輕度脫水而且嘔吐不重者，可口服補液，who推薦的口服液配方為氯化鈉，碳酸氫鈉，氯化鉀,葡萄糖或蔗糖,加水。脫水或嘔吐較重者，可靜脈輸入生理鹽水、等滲碳酸氫鈉和氯化鉀溶液以及葡萄糖。
減少腸道蠕動和分泌性藥物
可小量應用阿托品、顛茄、普魯本辛以減輕腸道蠕動，可止痛及止瀉。也可應用氯丙嗪，有鎮靜作用，并可抑制腸毒素引起的腸粘膜過度分泌，使大便次數及便量減少。
具體方法
1、禁食1-2天，進行補液、消炎、糾正酸中毒。可采用方法有： ·葡萄糖鹽水30毫升/千克體重，5%碳酸氫鈉2毫升/千克體重，靜脈滴注。
·硫酸卡那霉素3-5萬單位/千克體重、地塞米松2-4毫克/千克體重、肌肉注射，2次/日，連續3-5日。
·慶大霉素1萬單位/千克體重，地塞米松2-4萬單位/千克體重，肌肉注射，2次/日。
2、有出血癥狀的可肌肉注射止血敏15-20毫克/千克體重，2次/日。或vk3 0.2-0.3毫克、vk1 毫克/千克體重，肌肉注射，2次/日。
3、止吐可用胃復安，1-2毫克/千克體重，肌肉注射，2次/日。
4、寄生蟲性腸炎時，除上述療法外，應給予驅蟲藥治療。
常見腸炎藥品
整腸生(口服地衣芽孢桿菌膠囊)
【適 應 癥】本品主要用于細菌或真菌引起的急、慢性腸炎、腹瀉。也可用于其它原因(如長期服用廣譜抗生素)引起的腸道菌群失調的防治。
腸炎寧糖漿
【適 應 癥】清熱利濕、行氣。用于急、慢性胃腸炎、腹瀉，細菌性痢疾，小兒消化不良。
腸炎寧片
【功效主治】清熱利濕行氣用于急慢性胃腸炎腹瀉細菌性痢疾小兒消化不良(實習編輯:王楠)
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