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Nature:液體活檢獲重大突破!“驗血”就可以找到癌癥病變

來源:學術經緯   2018年11月15日 15:44 手機看

今日,癌癥研究領域傳來一條重磅新聞:一支聯合團隊開發的一種新方法,能通過簡單的“驗血”,找到只屬于癌癥的DNA特征。由于這種技術的靈敏度極高,我們甚至可以只用幾納克DNA,就分辨出癌癥的類型。這項研究今日也在線發表在了頂尖學術期刊《自然》上。

癌癥為啥難治?很大一部分原因在于我們發現得不夠早。現代快速的生活節奏下,許多人疏于打理自己的健康,身體稍微有一點點不舒服,根本就不會放在心上。直到迫不得已,社會精英們才會去醫院檢查身體。而一旦發現癌癥,往往就已經病入膏肓。

那為啥不定期去做個體檢,盡早發現癌癥的苗頭呢?一是價格,二是時間。說到底,高昂的金錢和時間成本讓人們覺得不方便。于是怕麻煩的人就開始暢想,要是可以像驗血一樣,簡單做個血檢就能找到癌癥發病的跡象,那該有多好?

▲驗血查癌,這是許多人的夢想(圖片來源:Pixabay)

既然普通人都想到了,科學家們還會想不到嗎?近幾年,無論是頂尖的生物學家,還是手握大量資金的風險投資機構,都對一種叫做“液體活檢”的技術產生了極大的興趣。故名思議,這種技術就是從人體的各種體液里進行“活體檢查”,尋找疾病的蛛絲馬跡。既然腫瘤也需要血液才能生長,血液里應該會有癌癥留下的信息。

順著這一思路,科學家們發現,循環腫瘤DNA(ctDNA)可能是一個不錯的檢測對象。這些DNA來自腫瘤,在人體內不斷循環。如果能提取出這些DNA,對它們進行測序,并發現和癌癥有關的種種突變,不就可以提前好多年發現癌癥了嗎?

▲血液里除了紅細胞,還有來自腫瘤的DNA(圖片來源:Pixabay)

這個設想看似天衣無縫,在實際操作上卻遇到了不少困難。一般來說,需要使用“液體活檢”的場合不多,一個是在癌癥發病前尋找到疾病的苗頭,一個是在癌癥得到治療后尋找復發的痕跡。但這兩類狀況都有一個共同點——癌癥不嚴重,所以來自腫瘤的DNA樣本并不多。和血液中來自正常組織的循環無細胞DNA(cfDNA)相比,它們的比例少之又少。想要找到相應的突變,談何容易?

那除了DNA突變外,我們還有哪些指標可以檢測呢?科學家們想到了表觀遺傳學。原來,不同的組織,不同的癌癥,都會在DNA上留下不同的甲基化修飾。這種修飾較多,理論上應該不難檢測。通過分析DNA的甲基化狀況,我們就可以推斷出,哪些DNA是來自腫瘤,哪些DNA是來自健康組織。在理想情況下,我們甚至還可以推斷出腫瘤的類型。

▲對于甲基化的分析,能夠解決DNA較少的難題(圖片來源:參考資料[1])

在實驗里,科學家們驗證了初步的想法——通過分析甲基化的變化,我們能對循環腫瘤DNA進行有效檢測。而為了解決cfDNA總體水平不高的難題,他們又對流程進行了優化,使用免疫沉淀技術,輔以高通量測序進行分析。科學家們指出,這種技術能有效使富含CpG(常見甲基化修飾位點)的區域得到富集,從而提高檢測效率。

這種技術的實戰效果如何?科學家們做了一個對比。他們獲得了24名早期胰腺癌患者的血漿cfDNA,并使用另外24名健康人的樣本作為對照。在兩組樣本之間,研究一共找到了14716個不同的甲基化修飾區域,得到不同修飾的CpG的數目高達45173。研究人員指出,這些數據足以表明,我們能夠通過這種技術找到來自腫瘤的DNA。

▲這項技術的可信程度不俗(圖片來源:參考資料[1])

在胰腺癌診斷上取得成功之后,科學家們自然開始設想,這種技術能不能用在其他癌癥的診斷上。于是,他們又開始評估這種技術在肺癌、白血病、乳腺癌、膀胱癌等癌癥中的應用價值。利用機器學習技術,他們開發的一款算法能夠以很高的準確度去區分這些癌癥。

在研究的最后,科學家們指出,這款技術還需要更多獨立數據的驗證。但對cfDNA甲基化進行分析,有望帶來一種非侵入性、低成本、靈敏度高的早期癌癥檢測手段,造福患者。

希望在不久的將來,檢測癌癥就可以像驗血一樣容易,做到早發現,早治療,把癌癥扼殺在萌芽之中。到了那個時候,我們再也不會因為沒有及時發現親人的癌癥,而抱憾終身。

參考資料:

[1] Shu Yi Shen et al., (2018) Sensitive tumour detection and classification using plasma cell-free DNA methylomes, Nature, DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-018-0703-0

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