對人類腫瘤進行全基因組測序（whole-genome-sequencing, WGS）可顯示出獨特的突變模式，這些突變模式有助于揭示癌癥的病因。

在一項新的研究中，來自英國劍橋大學(xué)、倫敦國王學(xué)院和韋爾科姆基金會桑格研究所的研究人員對324種暴露于79種已知或潛在的環(huán)境致癌物的人誘導(dǎo)性多能干細(xì)胞（ips細(xì)胞）進行全基因組測序，以便研究其中的突變特征。相關(guān)研究結(jié)果于2018年4月11日在線發(fā)表在Cell期刊上，論文標(biāo)題為“A Compendium of Mutational Signatures of Environmental Agents”。

圖片來自Cell (2019), doi:10.1016/j.cell.2019.03.001。

這些研究人員發(fā)現(xiàn)41種已知或潛在的環(huán)境致癌物產(chǎn)生了特有的替換突變特征。其中的一些突變特征類似于在人類腫瘤中發(fā)現(xiàn)的突變特征。此外，6種環(huán)境致癌物產(chǎn)生雙替換突變特征，8種環(huán)境致癌物產(chǎn)生indel（insertion or deletion, 插入或刪除）突變特征。

再者，這些研究人員通過研究基因組拓?fù)鋵W(xué)結(jié)構(gòu)中的突變不對稱性，揭示出完全功能性錯配修復(fù)途徑和轉(zhuǎn)錄偶聯(lián)修復(fù)途徑（transcription-coupled repair pathway）處于活性狀態(tài)。環(huán)境誘變劑誘導(dǎo)的DNA損傷可以通過不同的修復(fù)和/或復(fù)制途徑來加以解決，這就導(dǎo)致各種特征性結(jié)果產(chǎn)生，即便是存在單個環(huán)境誘變劑，也是如此。

這種對實驗誘導(dǎo)的突變特征的概要允許進一步探索環(huán)境致癌物在癌癥病因?qū)W中的作用，并強調(diào)了人類干細(xì)胞DNA如何會直接受到環(huán)境致癌物的影響。

參考資料：Jill E. Kucab et al, A Compendium of Mutational Signatures of Environmental Agents, Cell (2019). DOI: 10.1016/j.cell.2019.03.001.