肥厚型心肌病起病緩慢，預后相對較好，多數患者可長期生存，但猝死可發生于病程的任何階段。死亡原因為室速、心衰、栓塞及感染性心內膜炎等。
肥厚型心肌病的自然病史有高度變異。發病越早則預后越差，最主要的問題是猝死，在青少年或年輕患者，猝死常是首發癥狀。在住院患者中，猝死的發生率為每年2%~6%；若考慮所有的肥厚型心肌病患者，年病死率約為1%。本病進展緩慢，發病多年可無癥狀，多數患者可長期生存，但猝死可發生于病程的任何階段，年病死率約為3.5%。
肥厚型心肌病的臨床表現和自然病史的變化與年齡有關。兒童患者預后較差。肥厚型心肌病有一定的猝死率，來自幾個中心的統計表明，肥厚型心肌病病人年死亡率為2%~4%，而在兒童達6%，猝死占死亡患者的50%。（實習編輯：王凌）
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