首先明確為原發性還是繼發性高血壓，確診為原發性高血壓用排除法，除外各種可能的繼發因素。結合相應的病史、癥狀和體征，進行相應的實驗室和輔助檢查，以盡早明確繼發性高血壓的病因診斷。

原發性高血壓因起病隱匿緩慢并常無癥狀，易被忽視，故應把測量血壓列為定期兒童體檢的常規內容，以便早期發現。如一旦疑有高血壓，則需定期測血壓。如血壓繼續升高超數周或數月，即應做其他檢查以除外繼發性高血壓。原發性高血壓可依患兒的年齡(通常在10歲以上年長兒)，血壓輕度升高，體重輕到中度肥胖，陽性家族史，沒有原發疾病的癥狀及體征等來提示診斷。

繼發性高血壓的診斷主要是查找原發病，根據患兒年齡、高血壓的程度、或癥狀和體征。病史中有間斷發熱者應注意泌尿道反復感染(反流性腎病)。身高、體重低于正常提示有慢性疾病。注意腹部兩側有無腫物或腹部血管雜音。測量四肢血壓以排除主動脈縮窄，一般下肢血壓較上肢高10～20mmHg(1.33～2.67kPa)。單側肢體血壓減低或消失多見于多發性大動脈炎。篩查應包括血、尿常規、血清電解質、血尿素氮、血肌酐、尿酸等，疑感染者應作尿培養。慢性高血壓者應作心臟超聲及心電圖檢查，注意有無左室肥厚。

腎臟影像學檢查參見相關內容，超聲波檢查可了解腎臟大小、形態、集合管系統、腎臟病變或占位病變等。靜脈腎盂造影不能查到腎灌注的差異，放射性核素腎圖可鑒別分腎功能或瘢痕。腎多普勒超聲和血管造影可顯示動脈主干或分支的病變，及動脈、靜脈的異常血流，血管造影時可自雙腎靜脈和下腔靜脈取血查腎素活性。